通常パーツ(量産パーツ)を文字通り改造したパーツで、通常パーツと比べてパラメータが異なる。
装甲を追加・換装してAPや防御属性を強化・変更させたものや、補充ブースターを付け速度や旋回性能を向上させたものなど様々あり、
外観も通常パーツとは異なるものになっていため、よりアセンブルの幅が広がった。
これらのパーツはゲーム内に登場するキャラクター達が独自にカスタマイズしているという設定であり、
改造パーツを装備した相手を倒すことで入手することができる。
そのためかつてのチューンとは違い、自分で数値を変更することはできない。